Protein–RNA interactions for Protein: Q3UD82

Parp8, Poly [ADP-ribose] polymerase 8, mousemouse

Predictions only

Length 852 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Parp8Q3UD82 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Parp8Q3UD82 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Parp8Q3UD82 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Parp8Q3UD82 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Parp8Q3UD82 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp8Q3UD82 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp8Q3UD82 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp8Q3UD82 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Parp8Q3UD82 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms