Protein–RNA interactions for Protein: V9GX38

Gm17190, Predicted gene 17190, mousemouse

Predictions only

Length 357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17190V9GX38 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Gm17190V9GX38 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Gm17190V9GX38 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
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