Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z2Q2

Knop1, Lysine-rich nucleolar protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Knop1Q9Z2Q2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Knop1Q9Z2Q2 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Knop1Q9Z2Q2 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms