Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z255

Ube2a, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 A, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2aQ9Z255 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Arhgef40-220ENSMUST00000182909 5108 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Fgd6-201ENSMUST00000020208 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Trim2-203ENSMUST00000107691 7428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Rps6ka5-201ENSMUST00000043599 4406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Crem-234ENSMUST00000154470 1996 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Nacad-201ENSMUST00000045713 4892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Pcdh7-203ENSMUST00000191837 8785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Ints1-201ENSMUST00000072607 7102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Ksr1-207ENSMUST00000226282 5260 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Arvcf-205ENSMUST00000115614 4698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Eif4ebp2-201ENSMUST00000020288 5784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Gemin5-205ENSMUST00000172035 6213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Hps5-201ENSMUST00000014562 4953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Pcdh10-201ENSMUST00000166126 7081 ntTSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Ube2aQ9Z255 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.73□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.5 ms