Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z0M3

Cdh20, Cadherin-20, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh20Q9Z0M3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 AL672049.1-201ENSMUST00000197943 91 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm9484-201ENSMUST00000195892 1159 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cdh20Q9Z0M3 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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