Protein–RNA interactions for Protein: Q9WVQ0

Pmfbp1, Polyamine-modulated factor 1-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,022 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Pmfbp1Q9WVQ0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Pmfbp1Q9WVQ0 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms