Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU72

Tnfsf13b, Tumor necrosis factor ligand superfamily member 13B, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfsf13bQ9WU72 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem241-205ENSMUST00000209859 1426 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38973-201ENSMUST00000206810 878 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Tnfsf13bQ9WU72 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Tnfsf13bQ9WU72 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms