Protein–RNA interactions for Protein: Q9WU38

Scnn1b, Amiloride-sensitive sodium channel subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scnn1bQ9WU38 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm8369-204ENSMUST00000188633 1227 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Pwwp2b-201ENSMUST00000093993 3057 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 AC163637.2-201ENSMUST00000213826 1945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm37319-201ENSMUST00000193500 636 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 AC154634.3-201ENSMUST00000224589 736 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Atg16l2-202ENSMUST00000122116 2083 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm17193-201ENSMUST00000116345 691 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm6736-201ENSMUST00000166583 948 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Rbpms-202ENSMUST00000033995 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Scnn1bQ9WU38 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scnn1bQ9WU38 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.5 ms