Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1R0

Lhx6, LIM/homeobox protein Lhx6, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lhx6Q9R1R0 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 4930471E19Rik-201ENSMUST00000219022 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ankle1-202ENSMUST00000120725 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Prkaca-201ENSMUST00000005606 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm22885-201ENSMUST00000157410 107 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Auts2-212ENSMUST00000178555 309 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cnot2-201ENSMUST00000020374 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm14057-201ENSMUST00000120631 482 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm3149-203ENSMUST00000179649 618 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Mir124-2hg-207ENSMUST00000189868 535 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm15396-201ENSMUST00000209101 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Il2-201ENSMUST00000029275 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gnat3-201ENSMUST00000030561 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Krcc1-201ENSMUST00000080949 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm29331-201ENSMUST00000187215 605 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm19324-201ENSMUST00000213229 1169 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Rnf212-201ENSMUST00000068946 288 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Lhx6Q9R1R0 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 H2-DMa-201ENSMUST00000042121 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Ncmap-205ENSMUST00000105860 2000 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Gm38216-201ENSMUST00000194872 1214 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Lhx6Q9R1R0 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.1 ms