Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZM3

Clcf1, Cardiotrophin-like cytokine factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clcf1Q9QZM3 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Clcf1Q9QZM3 Eif4g3-205ENSMUST00000105831 6235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Clcf1Q9QZM3 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86 ms