Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZD4

Ercc4, DNA repair endonuclease XPF, mousemouse

Predictions only

Length 917 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc4Q9QZD4 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ercc4Q9QZD4 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ercc4Q9QZD4 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms