Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY23

Pkp3, Plakophilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 797 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkp3Q9QY23 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Fkbp3-201ENSMUST00000021332 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Pkp3Q9QY23 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Pkp3Q9QY23 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.6 ms