Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXZ9

Opn4, Melanopsin, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn4Q9QXZ9 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Gm2270-201ENSMUST00000222858 797 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Opn4Q9QXZ9 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.4 ms