Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a6-202ENSMUST00000070152 4219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Nat8f7-201ENSMUST00000160534 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Nat8f3-201ENSMUST00000050780 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Dagla-201ENSMUST00000039327 5634 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Areg-201ENSMUST00000031325 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Dscc1-202ENSMUST00000110231 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Myh14-201ENSMUST00000048102 6457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Rhd-201ENSMUST00000030627 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.42□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Lrrc7-205ENSMUST00000200137 7321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Adam11-201ENSMUST00000068150 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Adamts15-201ENSMUST00000065112 5928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Slc39a11-201ENSMUST00000042657 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Kcnip3Q9QXT8 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms