Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXA5

Lsm4, U6 snRNA-associated Sm-like protein LSm4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 137 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm4Q9QXA5 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.28
Lsm4Q9QXA5 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC13.23□□□□□ -0.29
Lsm4Q9QXA5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.23□□□□□ -0.29
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