Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX29

Trpc5, Short transient receptor potential channel 5, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc5Q9QX29 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Tgfb1i1-203ENSMUST00000163609 1053 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Pgrmc1-201ENSMUST00000073339 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Esd-207ENSMUST00000176957 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 P2rx6-203ENSMUST00000171002 1353 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Eef1akmt4-201ENSMUST00000115522 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 1190007I07Rik-204ENSMUST00000183416 637 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Hmgb3-201ENSMUST00000015361 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Ube2i-208ENSMUST00000173084 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gtpbp10-201ENSMUST00000088842 941 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Atp6v1c2-208ENSMUST00000221129 1425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Cep250-203ENSMUST00000109618 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Trpc5Q9QX29 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Snai3-201ENSMUST00000006762 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Zdhhc23-202ENSMUST00000165648 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Mir1895-201ENSMUST00000122615 79 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Trpc5Q9QX29 A930016O22Rik-201ENSMUST00000047020 1214 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.2 ms