Protein–RNA interactions for Protein: Q9QX15

Clca3a1, Calcium-activated chloride channel regulator 3A-1, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clca3a1Q9QX15 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Clca3a1Q9QX15 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Clca3a1Q9QX15 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 60.8 ms