Protein–RNA interactions for Protein: Q9QWW1

Homer2, Homer protein homolog 2, mousemouse

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Homer2Q9QWW1 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Homer2Q9QWW1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm7461-201ENSMUST00000058918 827 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Ephx4-201ENSMUST00000049146 1279 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Mtrf1l-201ENSMUST00000019908 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Homer2Q9QWW1 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms