Protein–RNA interactions for Protein: Q9QVY8

Rai2, Retinoic acid-induced protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 529 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rai2Q9QVY8 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Rai2Q9QVY8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Cenpp-201ENSMUST00000021818 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Rai2Q9QVY8 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms