Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK3

Cln8, Protein CLN8, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cln8Q9QUK3 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Cln8Q9QUK3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms