Protein–RNA interactions for Protein: Q9QUK0

Cdkl2, Cyclin-dependent kinase-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 568 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl2Q9QUK0 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Dlgap1-207ENSMUST00000133983 7173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cdkl2Q9QUK0 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cdkl2Q9QUK0 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms