Protein–RNA interactions for Protein: Q9JMK2

Csnk1e, Casein kinase I isoform epsilon, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1eQ9JMK2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pip5k1c-202ENSMUST00000105327 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Csnk1eQ9JMK2 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms