Protein–RNA interactions for Protein: Q9JME2

Chst11, Carbohydrate sulfotransferase 11, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chst11Q9JME2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Chst11Q9JME2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms