Protein–RNA interactions for Protein: Q9JL56

Gde1, Glycerophosphodiester phosphodiesterase 1, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gde1Q9JL56 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 AL731706.1-201ENSMUST00000227806 944 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm28411-202ENSMUST00000191318 464 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Mettl27-205ENSMUST00000111221 1796 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Jam2-201ENSMUST00000098407 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Gde1Q9JL56 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Gde1Q9JL56 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms