Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKN6

Nova1, RNA-binding protein Nova-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nova1Q9JKN6 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nova1Q9JKN6 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm6089-201ENSMUST00000197666 938 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Nat8b-ps-201ENSMUST00000162660 699 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Cmtm3-204ENSMUST00000212081 850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tomm20l-201ENSMUST00000021482 578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 2010003K11Rik-201ENSMUST00000048482 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 1700045H11Rik-201ENSMUST00000128056 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nova1Q9JKN6 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms