Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKK8

Atr, Serine/threonine-protein kinase ATR, mousemouse

Predictions only

Length 2,635 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AtrQ9JKK8 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Diablo-202ENSMUST00000111586 719 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Diablo-201ENSMUST00000031385 681 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Spata3-209ENSMUST00000152501 743 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Efcab8-203ENSMUST00000175856 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Tmem176a-202ENSMUST00000168406 1086 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC13.02□□□□□ -0.32
AtrQ9JKK8 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 H2-Q10-201ENSMUST00000068291 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Zfp637-202ENSMUST00000112859 421 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Pam16-201ENSMUST00000014445 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm37667-201ENSMUST00000193103 752 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Esrrb-206ENSMUST00000167891 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Sirt5-211ENSMUST00000223194 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Rabep1-208ENSMUST00000179114 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Tmem269-202ENSMUST00000212054 1504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm13613-201ENSMUST00000126240 1444 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Kxd1-204ENSMUST00000121623 884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 4930445N18Rik-202ENSMUST00000181345 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 CT030161.3-201ENSMUST00000218235 367 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
AtrQ9JKK8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.9 ms