Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKF6

Nectin1, Nectin-1, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nectin1Q9JKF6 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Nectin1Q9JKF6 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nectin1Q9JKF6 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms