Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
Trem3Q9JKE1 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Trem3Q9JKE1 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms