Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJY3

Smpd3, Sphingomyelin phosphodiesterase 3, mousemouse

Predictions only

Length 655 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd3Q9JJY3 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Tmem170-201ENSMUST00000034431 3878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Smpd3Q9JJY3 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Smpd3Q9JJY3 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms