Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Bco1Q9JJS6 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Bco1Q9JJS6 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.5 ms