Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJN6

Ctnnbip1, Beta-catenin-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctnnbip1Q9JJN6 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 AC013548.1-201ENSMUST00000228850 4738 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Pkn2-201ENSMUST00000043812 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.31
Ctnnbip1Q9JJN6 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Ctnnbip1Q9JJN6 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms