Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Riox1Q9JJF3 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Riox1Q9JJF3 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms