Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Gm44771-201ENSMUST00000206975 626 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
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RabggtaQ9JHK4 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.74
RabggtaQ9JHK4 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
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RabggtaQ9JHK4 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Bex3-201ENSMUST00000053540 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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RabggtaQ9JHK4 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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RabggtaQ9JHK4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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RabggtaQ9JHK4 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
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RabggtaQ9JHK4 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC19.63■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Pik3r2-201ENSMUST00000034296 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
RabggtaQ9JHK4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
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