Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHF5

Tcirg1, V-type proton ATPase subunit a, mousemouse

Predictions only

Length 834 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tcirg1Q9JHF5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Tcirg1Q9JHF5 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms