Protein–RNA interactions for Protein: Q9EST1

Gsdma, Gasdermin-A, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmaQ9EST1 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
GsdmaQ9EST1 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
GsdmaQ9EST1 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms