Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES56

Trappc4, Trafficking protein particle complex subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 219 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc4Q9ES56 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Trappc4Q9ES56 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Trappc4Q9ES56 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms