Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Slc28a3Q9ERH8 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Slc28a3Q9ERH8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.8 ms