Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Galnt13-203ENSMUST00000112635 7531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Rims3-201ENSMUST00000071093 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.02
Rp2Q9EPK2 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Rp2Q9EPK2 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms