Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Mrpl4Q9DCU6 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Mrpl4Q9DCU6 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.1 ms