Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCT2

Ndufs3, NADH dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur protein 3, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 263 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufs3Q9DCT2 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ndufs3Q9DCT2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Evpl-201ENSMUST00000037007 6384 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Ndufs3Q9DCT2 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms