Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCN7

Rnft1, E3 ubiquitin-protein ligase RNFT1, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnft1Q9DCN7 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Rnft1Q9DCN7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Rnft1Q9DCN7 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms