Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Xab2Q9DCD2 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Tlx1os-201ENSMUST00000173437 620 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Xab2Q9DCD2 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms