Protein–RNA interactions for Protein: Q9DC28

Csnk1d, Casein kinase I isoform delta, mousemouse

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csnk1dQ9DC28 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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Csnk1dQ9DC28 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Csnk1dQ9DC28 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Csnk1dQ9DC28 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
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