Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBZ9

Syde1, Rho GTPase-activating protein SYDE1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syde1Q9DBZ9 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Pafah1b3-207ENSMUST00000155118 679 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm32031-203ENSMUST00000208993 649 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Lhx1os-201ENSMUST00000126072 589 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Syde1Q9DBZ9 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms