Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Swt1Q9DBQ9 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Swt1Q9DBQ9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms