Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBP5

Cmpk1, UMP-CMP kinase, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk1Q9DBP5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Urgcp-201ENSMUST00000053427 5527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Cmpk1Q9DBP5 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms