Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB90

Smg9, Protein SMG9, mousemouse

Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg9Q9DB90 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Serf2-201ENSMUST00000099475 525 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Best2-203ENSMUST00000209421 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Smg9Q9DB90 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Smg9Q9DB90 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.7 ms