Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA21

Smco2, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smco2Q9DA21 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Smco2Q9DA21 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smco2Q9DA21 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms