Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9F7

Speer4b, Spermatogenesis-associated glutamate (E)-rich protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Speer4bQ9D9F7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Methig1-201ENSMUST00000075675 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Gm29246-201ENSMUST00000189221 349 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Rpsa-ps1-201ENSMUST00000191040 886 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 6430573P05Rik-202ENSMUST00000192648 597 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Speer4bQ9D9F7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Speer4bQ9D9F7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms