Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8X5

Cnot8, CCR4-NOT transcription complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnot8Q9D8X5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Acbd6-201ENSMUST00000035560 5592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cnot8Q9D8X5 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Cnot8Q9D8X5 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms